1980年月
，天下相繼發生怪異的事务


。宇宙物理學的國際權威御手洗博士
，除了忠言有危機迫近外
，還在自家的地底建设了研究所
，並建设以現代科學精英組成的調查組織
，SGM(Science Guard Members)


。新聞攝影師鏡京太郎在母親死後
，借居在御手洗博士家中


。有一天他被神秘人襲擊
，但被一片鏡中的光救了他


。京太郎其後從博士處知道了自己的身世
，並為了保護地球清静
，而成為了異次元天下超人·鏡子超人


。片中的敵人稱為Invader(インベーダー)
，屬於侵略地球的神秘生物


。