在上一季的季末，一场瘟疫的爆发让玛丽和弗朗西斯之间泛起了严重的问题：弗朗西斯执意要去接Lola(安娜·帕波维尔 饰)回来，而玛丽则以为他应该越发重视身为王者的责任
。最后，一道落下的城门让许多美剧迷担心，弗朗西斯还能在世回来吗?在《风中的女王》第二季中，弗朗西斯虽然在世回来了，但这场瘟疫还在继续，成千上万的人因此死去，整个法国都受到了极大的影响
。正是在这种岌岌可危的状态下，弗朗西斯最先了新的统治，而宗教和政治问题将严重影响他与玛丽的婚姻，也会影响到两个国家的人民
。